挖方是从室外地坪标高开始算起的。而回填是要填到正负零的标高。就是说你的室外地坪标高不是正负零的话,这很正常。
是不是你的地下部分有墙体形成了封闭区域,估计是软件把那部分当成是地下室也扣了吧,你再看看你的室内外高差设得对不对。最好的办法是点击“查看计算式”,看看软件是怎么算的。