有区别，学习的侧重面不一样，电气工程及其自动化主要侧重电力工程与工业设备的自动化系统，农业电气自动化应该侧重农业需要用到的一些电气与机械设备吧
电气工程及其自动化是电气，农业电气自动化是电化。在学术方面，电化是强电和弱点的结合，电气主要学的是强电。
我当初学的是冶金电气化专业，主干课程却都是电气工程自动化的专业课程，只不过有两门冶金行业的科普罢了，另外专业英语的课文是偏向冶金行业应用。这么说吧农业电气自动化其实就是掺和一点农业科普的课程的电气自动化。
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