整个校区将分为:二级学院区、公共教学区、生活区、体育中心区、配套功能辅助区等不同区域。新校区主要建设内容为:公共教学楼群、图文信息中心、科研大楼、各个学院楼群、教师办公及行政用房、学生宿舍、体育中心、水训站和其他教学附属用房等。 新校区于2004年9月开工建设,于2007年9月完成部分校舍的建设,新生进入新校(约5000人规模);2008年10月18日,学校隆重举行新校落成庆典。
根据上海海事大学战略发展规划,最终发展规模是在校学生数达到并稳定在20000人左右。至2010年,在校本科生15000人,研究生5000人(其中博士研究生800人)。