给你一个大致的筛选标准：
（1）选择长度≥200bp，Exon个数≥2的转录本；
（2）通过计算每条转录本的Reads覆盖度，选择Reads最小覆盖
度≥3的转录本；
（3）去除已知的mRNA转录本(通过和已有注释文件比对)
（4）去除已知的非编码RNA转录本（比对一些已有的lncRNA数据库了）
（5）去除有蛋白家族的转录本（能够注释到Pfam数据库）；
（6）去除有编码潜能的RNA（CNCI，CPC，这两款软件都可以给出一个编码能力的预测）
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