双方达成还款协议了，就等于是和解了，法院可以应当事人的请求，审查协议的合法性，按照协议的内容出具调解书，如果被告未按照调解书的内容执行的，原告可以在法定期限内申请法院强制执行。如果撤诉的话，被告未按照协议履行还得重新再次起诉，这样对原告不利，因此还是不要撤诉的好。如果法院不同意，让法院看着办就行了，坚持不撤诉。
