工程案件（朋友太可怜了，恳请懂行的律师帮帮忙，感激不尽！）

1、诉讼费83000元。
（财产案件根据诉讼请求的金额或者价额，按照下列比例分段累计交纳：
1.不超过1万元的，每件交纳50元；
2.超过1万元至10万元的部分，按照2.5％交纳；
3.超过10万元至20万元的部分，按照2％交纳；
4.超过20万元至50万元的部分，按照1.5％交纳；
5.超过50万元至100万元的部分，按照1％交纳；
6.超过100万元至200万元的部分，按照0.9％交纳；
7.超过200万元至500万元的部分，按照0.8％交纳；
8.超过500万元至1000万元的部分，按照0.7％交纳；
9.超过1000万元至2000万元的部分，按照0.6％交纳；
10.超过2000万元的部分，按照0.5％交纳。）
2、工程尚未竣工，如何进行初步结算？甲方盖章即产生法律效力。只有能够证明对方欺诈，才有可能挽回损失。但从你的描述看，比较困难。建议从显失公正入手，分析一下可能性。
3、标的1000万元不算大，一般应当由基层法院审理。
4、如果胜诉，公司乙应返还公司甲工程款的利息，利息按银行同期计算。看要求赔偿直接损失，但不能包括间接损失 。
5、诉讼时效是个重要问题，如果有双方交涉的证据，诉讼时效就中断，主要看这些证据距离起诉的时间，只要不超过两年就行。

1 有诉讼费用的计算公式，我需要到所里查一下我随身不带
2 评估后成为证明材料
3 你说的材料不是很清楚，所以，无法判断协议的性质，无法答复
4 标的额大小是法院管辖的一个条件
5 其他损失可以在诉讼请求中提起，但是只是直接损失，不包括间接损失
6 关于诉讼时效问题，要看你打电话其间是否体现了打电话时候的时间。
其次，可以根据电话费用单来做一些说明，来证明诉讼时效的中断

应该直接找律师咨询，这样更有时效性，而且你问的问题也更详细一些。
这类案子应由区人民法院管辖。
广东云天律所