火影忍者中晓组织的首领到底是谁？

漫画中的结论是，宇智波斑是“晓”的幕后老大，幕前老大是佩恩。
一个关系着宇智波一族历史和写轮眼的秘密的神秘人物，一个天才忍者，木叶村创始人之一，“晓”幕后人物，宇智波一族的一个小巅峰。

漫画中的表现：

宇智波斑(Uchiha Madara)比其他成员较晚加入‘晓’。赤砂蝎死后，宇智波斑才以鸢的身分加入了晓，称呼其他成员为前辈。他与地达拉搭档前往执行回收三尾的任务。初时表现极滑稽，说话口没遮拦，常不小心得罪队友迪达拉。
在一次‘晓’的集会上，迪达拉得知大蛇丸被佐助杀死后极为震怒，并因此打算找佐助算帐。据迪达拉称，这是因为杀死大蛇丸原本是其接下的任务，没想到却被佐助抢先一步。与佐助的战斗中，迪达拉败阵下来，最后为了证明自己的艺术而自行爆炸。可惜佐助熟练地运用了写轮眼，进入万蛇体内，用时空间忍术跃入其他空间，成功离开爆炸之地，得以保命。而迪达拉和鸢(阿飞)（宇智波斑），根据绝的观察，已经在爆炸中死亡。
但鸢于漫画第364话再次出现，并自称是‘宇智波斑’，而且拥有写轮眼。同时他能对潘恩发出命令，推测是‘晓’的幕后黑手。
在漫画第370话中，自来也表示宇智波斑为宇智波一族的创始人。他被歌颂为最强的忍者，斑使用永远的万花筒写轮眼力量一个接一个地统治了忍者一族，接着与传说中忍术最强的森之千手一族携手设立了新的组织。这个组织后来就成为了木叶暗部。之后，斑与千手一族的族长（也就是之后的初代火影）围绕村子的方针产生了对立。斑虽然在争夺主导权上失败，但现在他依旧与那瞳力共同存在着。他成立了“晓”这个组织，在其背后隐藏着自己，并一直生存到现在。又曾与宇智波鼬一起灭绝宇智波一族，在鼬口中是亦师亦友不灭的男人，亦是鼬妄想要取代的人。
斑有一特征，就是拥有‘永恒之万花筒’。斑另有一弟弟，一起开启了万花筒写轮眼。接着，兄弟两人用这瞳力统治宇智波一族，作为哥哥的斑成为了族长。但斑却因为过度使用万花筒写轮眼而导致失明。为了拥有永远光明的万花筒写轮眼，便强行从弟弟夺去写轮眼，意外造就了‘永恒之万花筒’的诞生，非但脱离了失明的命运、亦拥有独特性的新瞳术。这亦影响了后世的宇智波族人，为了寻求这种永生的眼睛而互相残杀起来，但谁都没法得到。因此事”宇智波一族〃被宇智波鼬喻为“原来宇智波一族是因万花筒写轮眼残杀好友...，因永远的瞳力残杀亲兄弟，还一直夸耀着那种力量存续至今的肮脏一族。”
斑还拥有控制九尾的力量。在之前九尾跟佐助的对话中，九尾提及跟宇智波斑见过面，也见识过其写轮眼的力量。而在鼬与佐助的对话中，亦得知宇智波斑曾以万花筒写轮眼驯服过“九尾”;十六年前袭击木叶的‘九尾妖狐’，亦是他所召唤，只是为第四代火影所阻止。
宇智波斑对宇智波佐助的行动了如指掌，期盼著佐助的演变。现与鸣人等人相遇。因具有让敌人法术穿过身体的特殊能力，化解了鸣人的螺旋丸攻击。卡卡西决定让同样拥有秘术的志乃来应付他，但他似乎拥有比四代更厉害的‘时空间忍术’，能随意让身体受攻击部份转移，故此志乃的‘秘术·虫玉’及牙的‘通牙’攻击均亦告失败。此时绝前来向宇智波斑汇报战况，得知佐助击败宇智波鼬，决定弃战而去;但他眼中的‘三玉’写轮眼，不禁令卡卡西汗颜。之后与绝前往佐助所在之地。从绝的说话中，可以知道斑的移动速度像光速一样。他命令绝把鼬的尸体带走，而且日后要回顾佐助与鼬的战斗;同时亦把重伤的佐助带走。当佐助醒来时，告诉佐助自己不是他的敌人，并打算向佐助透露关于鼬的真相，及揭开自己一直蒙着的神秘面纱……

斑不如鼬的推论
网友都认为斑是宇智波族的一个小巅峰，不如U强，这不是个人喜好，是有根据的。
斑是被初代打败的，而三代是历代中最强的火影，三代又是被大蛇丸所杀，大蛇丸败给鼬。所以相信如果鼬和斑过招的话，输的就是斑。

但是，班拥有永恒的万花筒写轮眼，到底怎么不能确定

宇智波家族的分裂
在斑出场之后我就有一个疑问，为什么宇智波一族曾在木叶过着平静的生活，却有这么个老妖精祖宗在外头干恐怖活动？为什么斑被初代打败之后是一个人离开，而没有带走族人？斑是族长，本应该是一呼百应的人物，为什么会沦落成鼬口中的“丧家犬”？我有一个猜测可以解释：宇智波家族曾发生过分裂和内讧。
设想为了复明而残害手足的斑，多半是个残忍暴虐的人。在建立木叶后，斑与稳健派的鼻祖初代，在治理村子，甚至召唤九尾的观点上一定是矛盾的。如果我是斑，首先就会想到利用家族这个强大的后盾与初代争锋，而不是终结谷一战定输赢。但结局却是斑狼狈的败走了，而且是挥一挥衣袖，不带走一个部下。
我的猜测是，在木叶建立后，和平的环境会引起大家对战斗生活的厌倦。即使是“血腥肮脏”的宇智波一族也可能分裂成武斗派和保守派。更多的人向往一族间的和平与“族”的强大，而不是追求究极力量的个人强大。“需要时你就是老大，不需要时你就是‘族’的绊脚石”——这种想法逐渐在族众中出现。甚至可能有人认为斑才是祸首，因为正是斑的开眼，才引起族人的效仿，才引起血腥和屠杀。被保守派渐渐孤立起来的斑，一定不会甘心，于是一场宇智波内讧发生了，最终演变成斑及拥护斑的族众与整个木叶的对立，引发了斑与初代的决斗。
以上的推测来自于佐助回忆中的一些情节：
像鼬对佐助说的“虽说现在宇智波一族人员减少了，不过差不多都隶属于这个部队”——这个“减少”是否指的是一次内讧导致的呢？ “所谓优秀也是有烦恼的，有了力量就会被人孤立，也会变得傲慢起来，即使最开始被他们寄予了最大的期望。”——这是鼬自己的感受，但是否也是斑曾经历的呢？推想斑作为鼬的导师和朋友，一定让鼬了解了自己的过去，从而得到了鼬的认同。

宇智波家族的和平发展
战斗后幸存的宇智波族人，应该大部分都是“保守派”。他们继续生活在木叶，成为了木叶“名门”。他们建立起木叶警卫部队，“制裁忍者犯罪”说不定正是源于他们成功镇压了斑的叛乱。同时他们也封存了写轮眼的两个秘密，掩藏起了家族血腥肮脏的历史，成为了优秀却也平庸的忍者一族。
但宇智波家族和木叶似乎并非完全信任的关系，他们家族自治的状况很明显：经常有秘密的聚会，有采集物资的秘密基地等等。这一切都被小心的掩盖起来，屠杀的历史也不例外，也许只有族中的高层才了解个中内幕。
宇智波家族的毁灭 宇智波家族和平发展了几十年，此后，继承了宇智波斑完美血继的终结者鼬诞生了。 鼬无疑是宇智波最了不起的唯一一个天才，他在加入暗部以前对家族的秘密是不知情的，他甚至教导佐助要以族徽为傲。但鼬在加入暗部以后，行为开始变得古怪，他应该是在这个时期遇到了斑，或者说是斑主动接触鼬。最大的可能是斑看中了鼬，告诉了他写轮眼的两个秘密，而且让他与自己的想法达成了一致——追求究极力量，“恢复写轮眼本来的面目”。斑与鼬彼此到底抱着什么心态现在还无法做明确的判断，鼬称他是“导师和朋友”，但根本上大约还是互相利用的关系吧。这儿有个巧合：斑是木叶暗部的创立者，而鼬是在加入暗部以后认识的斑，其中不知有没有联系。
鼬在这一阶段对家族无疑是蔑视和憎恨的，现在来看他与几个族人对峙时说的话真是别有深意：“总是‘一族一族’的，你们是高估了自己的能力，……执着于组织，执着于全族，执着于名气，这就是制约你们能力的忌讳之事，而且对于未知事物惧怕和憎恨，真是愚蠢之极。”可惜说到这儿时被父亲一声“住嘴”打断。后来在父亲的置疑下，鼬回答：“没有任何奇怪的地方，我不过是在履行自己的使命。”对于为什么没有参加聚会，鼬回答：“是为了接近颠峰”——这一系列对话在目前的阶段终于有了合理的解释，“使命”、“颠峰”的真面目也渐渐浮出水面。可以说386话不是AB突发奇想才画成这样的，而是一早就埋下伏笔，设计好的情节。
结果鼬的父亲出自爱子之心没有深究，只是决定由自己来监视鼬。这是否又是灭族的一个伏笔呢？灭族对于斑来说大概是件痛快的事，这些背叛者的子孙活该有此下场。但对于鼬意味着什么呢？难道没有负罪与痛苦吗？
总之，宇智波一族被斑这个变态给灭了，他们苦心保守多年的秘密掌握在了幸存的两个人加一个老妖怪的手上。如果按照宇智波最了不起的天才宇智波鼬的说法，斑就是个丧家之犬，拥有永远的瞳力，那他追求的究竟是什么？即使拥有了登峰造极的瞳术，斑也仍旧被初代打败，这又是为什么呢？虽然目前的情节还不甚明了，但尾兽这个主题一定是问题的关键，期待作者爆出更多的信息。
知道宇智波一族灭门惨案真相的第六人

那些都是一些网友自己的猜测,根本没有官方认证过..
看漫画就一清二楚了

首先四代是自来也的正式学生(徒弟),就像鸣人的老师是卡卡西一样

而佩恩当时是一个在忍界大战中无家可归的孩子(一共有三个孩子,佩恩应该是其中一个孩子,但佩恩是谁目前官方还没正式确认.)因为忍界大乱,而自来也是个善心的人,所以教他们一些忍术可以自保,但并不是正式的徒弟

自来也不是火影!自来也的师傅是三代火影,他的徒弟波风水门是四代火影

按照目前的情报,四代应该是死了,而鸣人就是四代的儿子,鸣人这个名字就是四代叫自来也起的,因为自来也有本书的主人公叫鸣人,四代很喜欢.所以他的儿子就叫鸣人..

目前鸣人妈妈是生是死官方没有说过..在哪里更不清楚

鸣人妈妈不是三代女儿,他妈妈不是火之国的,是旋涡国的

目前晓的成员已经全部出现:斑(阿飞).佩恩.小南(女的,是佩恩小时的同伴,也是自来也收留的徒弟之一).绝.鼬.迪达拉.赤砂之蝎.鬼鲛.飞段.角都.所以鸣人妈妈不是晓的

宇智波斑（阿飞）是晓组织老大，，佩恩是晓组织队长~~~~~~~~自来也是在人物中遇到佩恩小南他们并受为徒，，四代死了~鸣人是他儿子，他妈妈叫做漩涡奇奈，现在也死了~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~关于你说的“鸣人的妈妈是三代的女儿，也是晓的成员，代号“玉女”，排行第八。玉女不是赤砂之蝎又怎么是鸣人他妈呢
”这根本没这事~~我可以准确的告诉你：不要听信同人的谣言！！踏踏实实看漫画！！！

不要随便看写小道消息。
1.自来也是出于善意交他们忍术用于求生的，实际上又没有什么注册登记类的，只能算是个名义上的徒弟
2.鸣人的父母在第一本里说都死了，可敬的四代夫妇
3.鸣人的妈妈是涡之国的女忍

晓的老大是斑 鸣人的父亲是四代火影，母亲是漩涡奇奈。鸣人的母亲是涡之国的女忍（即漩涡一族的）。四代好像是死了，则漩涡奇奈不知道。 这雨忍的人是自来也在年轻的时候与纲手，大蛇丸一次任务中遇到的。当时他们还是些孩子，自来也见他们可怜，便留下来教他们一段时间。 （漫画中有更详细的内容，请不要相信小道消息）