A、染色体的主要成分是蛋白质和DNA分子，由于基因是有遗传效应的DNA片段，所以每条染色体上含有多个基因，基因在染色体上呈线性排列，A正确；
B、因为基因是有遗传效应的DNA片段，DNA和蛋白质结合组成染色体，DNA和基因都存在于染色体上，故三者行为一致，都能复制、分离和传递，B正确；
C、染色体不是遗传物质，而是遗传物质的主要载体，生物细胞内的遗传物质是DNA和基因，C错误；
D、因为基因和DNA在染色体上，所以染色体的行为决定着DNA和基因的行为，因此基因和染色体行为存在着平行关系，D正确．
故选：C．
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