美国留学生在本科未毕业的情况下怎么申请研究生？

你这情况还是很特殊的，对你的经历也是很遗憾。
我想问的是，你选课程的时候应该和导师沟通的，怎么就选了不被认可学分的课程呢？
不过美国也比较特殊，是允许选修这类课程，但不被纳入学分的，导师也可以认为你只是为了学习这门课的知识，而不是只为了毕业修学分。
通常我们给出的建议是，重修，但你前面考试不过又补修，应该也浪费了很多时间和精力了。
你现在应该是面对给父母交代，本已计划好攻读研究生的，也做了很多申请硕士的准备了吧，现在突然告诉你本科不能顺利毕业，其实也打乱了你的一切计划。
本科未毕业申请硕士，还是有途径的。

留学生在选择留学国家的时候，往往会选择英国、美国等等国家，而且会只顾排名，选择排名很高的学校，但是自己的学业压力却是比较严重，所以久而久之，会导致无法无法毕业的情况。这时候如果还想深造的话，肯定也是不太好的，并且回国工作可能都会遇到一些问题。
所以留学生在遇到困难的时候，一定首先要先调试好自己的心情，然后再冷静地看待问题，争取找到不错的解决办法。其实留学生在本科未毕业的情况下，进行硕士研究生的申请都是可以的。

根据您的问题，我认为可以提交资料申请。诚心为您解答，希望不吝采纳。