非独立核算又称报帐制，是把本单位的业务经营活动有关的日常业务资料，逐日或定期报送上级单位，由上级单位进行核算。
所以，我认为既然总公司决定用此种方式核算，自然对分公司的发展有一个比较全面的计划。那么我认为，不管分公司是否成立专门的财务部门，或是是生产经营范围不同，也应该与总公司保持一致。因为这样可以简化报账的程序与步骤。如果未来根据分公司的生产经营情况，需要更改科目设置问题。可以报请总公司董事会调整会计科目。
这个问题应该和你们总公司的财务来协调解决,既然是全部费用报到总公司,你们又不对外营业,好象没必要用和总公司不一致的财务再度吧,从你的描述中看得出,你们分公司其实就是总公司的研发部,虽然注册成了分公司,也不会对外经营,应该保持和总公司一致.
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