(1)∵OB=6,OA=4,且C在第一象限,
∴C的坐标为(6,4);
故答案为:(6,4);
(2)在Rt△OBF中,tan∠BOF==,OB=6,
∴BF=,
∴F(6,),
将F点坐标代入反比例解析式得:k=6×=16,即反比例解析式为y=,
∴将y=4代入反比例解析式得:x=4,即E(4,4),
在Rt△AOE中,OA=AE=4,
∴∠AOE=45°;
(3)存在,理由为:
设BF=a,由OB=6,得到F(6,a),代入反比例解析式得:k=6a;
由OA=4,得到4AE=k=6a,即AE=1.5a,
∴EC=AC-AE=6-1.5a,CF=BC-BF=4-a,
由∠EOF为锐角,不可能为直角,
故分两种情况讨论:
①当∠OEF=90°时,可得∠AEO+∠FEC=90°,
又∠AEO+∠AOE=90°,且∠OAE=∠ECF=90°,
∴△AOE∽△CEF,
∴=,即=,
整理得9a2-52a+64=0,
解得:a1=,a2=4,
∴F(6,);
②当∠OFE=90°时,同理△CEF∽△BFO,
∴=,即=,
整理得a2-13a+36=0,
解得a1=9,a2=4均不合题意,
∴∠OFE≠90°,
综上所述,当F(6,)时,△OEF为为直角三角形.