按照您的描述，很有可能是因为换的控制器与电机不匹配，电角度没有调整正确电流过大，进而导致热损耗。建议你选用与电动车相匹配的控制器。如果您用的就是电动车原厂的控制器，那么就有可能缺相了，注意查看电机三相线有没有松动。检测缺相最简单的方法就是将车子架起来空转，重复尝试在不同的轮子角度下启动，如果某个角度无法启动了 那么就是缺相，那就要换电机了。回答您第二个问题：因为您使用的是方波控制器，所以在没有正确匹配或者缺相的状态下也能骑，如果您一直这么骑下去的话，能量利用率肯定会降低很多（大部分损耗在热量上）。车上的电线如果不够粗的话可能会导致熔断，因为电流是很大的。对电机而言，寿命自然也会降低。所以，我建议您还是去查找一下控制器是否与电机不匹配。
电动车电机长时间运作一般表面温度高时有65°左右，这个温度会烫手的，但正常情况下它会在90分钟内进入热平衡状态，不再升温，可以继续骑下看看，这种电机我以前设计过，一般没问题。
你换的是万能的控制器......