多数沙眼根据乳头、滤泡、上皮角膜炎、血管翳、角膜缘滤泡及角膜缘滤泡的瘢痕化等比较特异的体征就可以诊断，但是由于早期的沙眼症状及体征不明显就需要实验室检查来明确诊断了。实验室检查包括角膜刮片检测、细胞培养法、原位杂交检测、PCR检测等。
