婆婆想把户口上在我们新房

不知道是不是各地政策不同，反正我知道的，至少昆明这边父亲是集体户口对孩子上学没影响。因为我见过高考报名的时候有学生父母都是集体户口的，就是办手续的时候需要多跑几个地方，其他没影响。一般来说现在是按小孩户口的片区上学，你们要是在南京学区买的房，孩子户口上在那里就好入学，跟孩子爸爸户口没什么太大关系。
另外产权分割和户口一点关系都没有，你们才新买的房且算不上动迁呢吧，房子产权是谁的，看房产证上写谁的名字，写你和你老公的名就跟你婆婆没关系。不过户口在居住地的确有很多便捷的地方，南京社保我不太了解，不过比如一些老年人的福利措施肯定是只给有本地户口的老人的，比如北京一定年龄的老人办个老年证可以免费逛公园；昆明老年人可以办办免费的公交卡（这个就是只有本地户口的人才能申请，外地人还要什么暂住证之类的很麻烦）。

最好不要同意，以后麻烦的事情太多，说的不好听的，以后为这些事情闹的话，你老公还是会站在他父母那边的，到时候哭都不知道为什么了。

房子如果是夫妻双方共有的，不论房子上户口有谁，所有权只归共有方。
房子是婚后购买的 即属于双方共有财产。
小孩上学一般看落户的地区，和你老公的集体户没啥关系。如果你老公集体户所在区有好学校，倒是可以考虑把小孩的户口落在你老公下面。（要是新房所在区也有差不多的学校，那还是落在新房上，毕竟落集体户比较麻烦，而且有些单位也不愿意）
你婆婆户口过来，对你没有任何影响。对她利益也有限。所谓享受南京社保，估计比较难。毕竟目前外地社保迁移还是比较麻烦的。