这是根据陈述句是用be动词还是实义动词决定的。陈述句用be动词，一般疑问句和特殊疑问句中都用be动词。陈述句中用实义动词，一般疑问句和特殊疑问句中用助动词。你的两个例句可以还原成陈述句:It is three metres from here. 这句谓语动词is是be动词。It takes three hours to go there.这句谓语动词take是实义动词。
