新疆主要地产中药材品种的大宗药材和特色药材主要为红花、枸杞子、赤芍、桃仁、杏仁、伊犁贝母、阿魏、新疆蒿本、天山秦艽、新疆秦艽、索索葡萄,民族医专用药材为无花果、孜然、巴旦杏、异叶青兰、沙枣、阿里红、刺糖、黑种草籽、菊苣、香豆子、阿月浑子、胡桐泪、一枝蒿、阿育魏实、芫荽、洋茴香、石榴等。上述品种中有很多为新疆秦艽、伊贝、新疆贝母、新疆蒿本、异叶青兰、新疆玉竹、新疆木香、新疆赤芍、天山堇菜、天山花楸等。产量最大的主要为红花、枸杞子、桃仁、杏仁、贝母、罗布麻叶等