请问RT-PCR的主要过程是什么?稍微详细点 谢谢~~

2024-12-22 07:06:11
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回答(1):

不晓得你说的是RT-PCR(reverse transcription PCR)呢,还是实时PCR(real-time PCR)。如果是反转录的话,步骤如下:

1.电泳定量RNA或直接测定RNA浓度。

2.反转录体系:(20 μl)
RNA+DEPC 水: 11μl, RNA量1-5μg
Oligo dT: 1μl
5X RTase Buffer: 4μl (10X RTase Buffer 2μl + 2μl DEPC 水)
Ribololck Rnase Inhibitor: 1μl
dNTP: 2μl
RTase : 1μl
Total:20 μl
42℃放置60min,70℃放置5min终止反应。
3.稀释母液模板,进行PCR反应。

回答(2):

买一个试剂盒 按照试剂盒说明来就行 注意低温操作

回答(3):

RT-PCR实验步骤
一.实验器具:
1.移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2.5μl
2.吸头:1ml、200μl、20μl
3.匀浆管:5ml
4.EP管:1.5ml、500μl、200μl
5.试剂瓶:棕色试剂瓶(广口,放75%乙醇)
6.量筒:100ml
7.容量瓶:1000ml
8.试管架:5ml、1.5ml、20μl
9.铝制饭盒:1-2个
10.大瓷缸:1个
11.锡泊纸:一卷
12.卷纸:2卷
13.三角烧瓶:带盖,稍大
二.实验器具处理
1.塑料制品:(包括枪头、EP管、匀浆管等)先将DEPC水从容量瓶中倒入瓷缸中,将塑料制品逐个浸泡其中(注意:小枪头要充分浸泡,必要时需要针筒打入DEPC水),过夜后取出(注意:DEPC水很难自然晾干,所以建议先将刚取出的DEPC物品甩干,枪头装入枪头盒后甩干,EP管和匀浆管装入饭盒后甩干,然后在37度孵箱烘干)。高压后烤干备用。如果DEPC处理过的物品时间已超过一个星期,再次使用前应再次高压。
2.玻璃制品:泡酸过夜,冲洗干净,先泡1‰DEPC过夜,再蒙锡纸烤干备用。
3.匀浆器:(包括剪刀、镊子)先洗净后,超声消毒即可(不需要泡DEPC)。
三.试剂配制
1.DEPC水:吸出1ml DEPC放在1000ml容量瓶中加双蒸水定容至1000ml,配成1‰DEPC水,并充分振荡混匀备用。
2.75%乙醇:用无水乙醇+DEPC水配,然后放-20℃保存(DEPC水需先高压,高压时注意:1.装DEPC水的瓶子在盖子和瓶之间要放上线头;2.高压时间在40-45分钟,所以水要适当多加一点;3.高压结束后,不要强行放气,要让压力自然下降,不然水会喷出)。
3.异丙醇:放入棕色瓶中。
4.氯仿:放入棕色瓶中。
5.琼脂糖
四.缓冲液配制
1.电泳缓冲液(5×TBE贮存液):Tris 54g、硼酸 27.5g、0.5M EDTA 20ml pH8.0、加蒸溜水至1000ml。使用时,将5×TBE稀释10倍成0.5×TBE就可以在电泳时使用(工作浓度)
2.上样缓冲液(6×缓冲液,4℃保存):0.25%溴酚蓝、0.25%二甲苯青FF、30%甘油
五.琼脂糖凝胶配制
1.1.0%:1.0g琼脂糖+100ml电泳缓冲液,微波炉加热至沸腾(如果首次煮胶,一定要煮透,以不出现泡沫为标志),熔化的琼脂物冷却至60℃时加入10mg/ml溴化乙锭2.5μl,充分混匀,将温热的凝胶倒入已置好梳子的胶膜中,在室温下放置30-45min(可以放入4度冰箱加快琼
脂糖凝固)后现进行电泳。
2.1.5%:同上,将琼脂糖的量改为1.5g
六.需购置材料
Taq酶(-20度保存)(配10×buffer和MgCl2):不需要使用高保真Taq酶,一般的就行。个人感觉天为时代的普通Taq酶就很不错。
dNTP(4度保存):向生物公司购买,原装和分装均可。
oligo(dT)15(-20度保存):可以向生物公司购买Invitrogen合成的廉价货,每支10元,稀释后使用(注意稀释浓度),也可以购买Promega的原装货,稀释10倍后使用,稀释液4度保存。
M-MLV(-20度保存):向生物公司购买,推荐使用Promega的,当然有钱可以购买更好的AMV。
RNasin(-20度保存):向生物公司购买,推荐使用Promega的,原装分装均可。
DEPC(4度保存):向生物公司购买,5克足矣。
Trizol(4度保存):有50ml和100ml规格,按照实验需要自己购买。国外进口的有Invitrogen(Trizol)、罗氏(Tri Pure)、MRC(Tri Reagent);国内的也行,天为时代的就不错。
Marker(4度保存):按照目的条带大小购买,推荐使用天为时代的Marker(物美价廉,上样2.5ul就很亮了,较3.0ul的Takara同样品种Marker为亮),本人很喜欢它的DL2000。
电泳Loading Buffer(4度保存):按照配方自己配制,不需要购买(购买的话价格挺贵)。
七.引物合成
1.内参照:GAPDH(452bp) 正义:5-ACCACAGTCCATGCCATCAC-3
反义:5-TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3
2.退火温度计算:2(A+T)+4(G+C),正反义平均数,再上下波动4-5度。
3.引物2 OD已足够,每管1 OD分装。
4.引物稀释:加DEPC水量(μl)= X nmol/OD(合成的引物管上有标注) × 管上所标OD数(推荐每管引物为1 OD分装,合成之前向公司说明这一点,切记!!)×100。最终引物浓度为10pmol /μl。
八.PCR产物电泳
取1-10μl(一般取5μl)PCR产物,加已点在纸上的6×上样缓冲液,反复吸打混匀后进行电泳,一般用稳压状态进行电泳,100V左右,电泳20-30分钟,紫外灯下观察,结果进行扫描保存。
九.注意点:1 逆转录后应立即冰水浴 2 RNA抽提前,打开离心机预冷
TRIzol法抽提总RNA
组织100mg/细胞1×107

加1mlTRIzol

组织:匀浆(彻底,分几次打,是匀浆时产生的热量能散出,后转至EP管)
细胞:用1ml加样器吹至液体澄清且无细胞团块

颠倒混匀10下,室温5分钟

加氯仿1/5体积(0.2ml)(必须按总体积的1/5)

颠倒混匀10下,室温5分钟

4℃,离心12000g,15分钟

转上层水相(约400μl)于另一1.5mlEP管中

加等体积异丙醇(约400μl),混匀室温10分钟

4℃,离心12000g,10分钟

弃上清

加冰预冷的75%乙醇(DEPC水配)1ml

4℃离心7500g,5分钟

弃上清,空气干燥5-10分钟(不能完全干燥)

溶于DEPC水中
注意:1.RNA若用于核酸转移应溶解于样本缓冲液中,否则DEPC溶解。
2.细胞组织加TRIzol匀浆后,可在-60℃放置至少一个月(甚至可一年以上)。
3.RNA在75%乙醇中,2-8℃至少可保存一周,-20℃至少可保存一年。
4.弃上清的操作,我们一般将EP管倒置在平铺于桌面的卷纸上,吸干。
5.最后一步弃酒精,将RNA溶于DEPC水的操作,我们的做法是:先按4的步骤吸干酒精,其实这样还是不彻底的,再将EP管小离心后用20μl小枪头(DEPC处理过的)吸出多余的酒精。最后用200μl中枪头(DEPC处理过的)吸11.5μl(20μl体系,如果是40μl体系则加倍)的DEPC水至EP管中,吹打助溶,然后转移至200μl的EP管(这些EP管中可以事先加好Oligo(dT)15,以节省枪头)中。
两步法RT-PCR
(第一步:逆转录反应:20μl体系,如果是40μl体系则加倍)
试剂 浓度 体积 终浓度
RNA 11.5μl
Oligo(dT)15 0.05μg/μl 2μl 0.005μg/μl
(0.05μg/μl Oligo(dT)15为Oligo(dT)15原液稀释10倍的浓度)

混匀,离心,70℃ 5min

立即冰水浴,稍离心

试剂 浓度 体积 终浓度
M-MLV Buffer 5× 4μl 1×
dNTP 10mM 1μl 0.5mM
RNasin 40U/μl 0.5μl 20μ
M-MLV 200U/μl 1μl 200U
总体积20μl

混匀,离心,42℃ 60min

95℃ 10min(破坏M-MLV)

4℃保存
(第二步:PCR反应:总体积20μl,如果50μl体系,相应加倍)
试剂 浓度 体积 终浓度
Taq Buffer 10× 2μl 1×
MgCl2 25mM 1.2μl 1.5mM
dNTP 10mM 0.2μl
上游引物 10pmol/μl 0.4μl
下游引物 10pmol/μl 0.4μl
cDNA模板 1μl
DEPC水 14.7μl
Taq酶 2.5U/μl 0.1μl

混匀

95℃ 5分 预变性
94℃ 30秒 变性
X℃ 30-40秒 退火
72℃ 30秒 延伸
72℃ 7分 终末延伸
(28-36循环,4℃保存)
注意:1.Taq酶、M-MLV、Rnasin等-20℃保存,操作时置于冰上。
2.dNTP保存在4度即可,勿反复冻融。
3.如果一次做很多管,可以先将共同需要的部分一起加(稍微多算一点,例如20管分装,可以加入21-22管的量,因为枪头会吸附一定的液体,可能有人认为这样会浪费试剂,其实不然,因为每管分开加的话试剂用量更多,枪头吸附的试剂的量其实也是很可观的,特别是国产的枪头,这样做同时还能降低加样误差),然后各管分装,再加各自不同的部分。
4.如果200μl的EP管在PCR过程中盖子容易炸开,解决方法有:(1)用封口膜将管口密封、(2)最后每管加入液体石蜡进行液封。

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