土壤呼吸是主要是微生物活动,有机质矿化不仅包括生物化学过程,还有纯化学过程的有机碳向CO2转化。但是,二者有相似之处,有机质矿化主要是通过微生物的呼吸实现的,在正常的土壤环境中,土壤呼吸是有机质矿化最主要的途径。