同时对一个物种进行转录组测序和建立cDNA文库有什么好处？

2024-12-04 07:22:22

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回答（1）：

转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有 RNA 的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是，转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下，其基因表达情况是不完全相同的。环境微生物生态多样性研究中的突出优势体现在：（1）测序序列长，便于聚类拼接，可以对转录本进行从头组装（de novo assembly）。（2）测序通量高，可以检测到低丰度转录本信息。（3）可以对无基因组参考序列的新物种进行转录组测序，发现新的转录本和亚型。（4）实验操作简单、结果稳定，可重复性强。无需进行克隆的文库构建，双链 cDNA 连接 454 接头后可以直接进行测序，实验周期短。（5）测序数据便于进行生物信息分析，可以进行基因差异表达分析、鉴定基因的可变剪切以及预测新基因。

回答（2）：

cDNA相比于转录组的优点是包含有该物种的全部转录本，可以便捷的克隆该物种的所需基因，而不必考虑时空表达的差异。

转录组的优点在于是某个特定时期的所有转录产物，可以用来研究某一生理条件或时空条件下该物种转录水平和正常情况下的差异。

话说昨晚似乎回答过你的这个问题。

回答（3）：

cDNA相比于转录组的优点是包含有该物种的全部转录本，可以便捷的克隆该物种的所需基因，而不必考虑时空表达的差异。