种子不行了，需要分纯。
经过多代培养和使用，菌种都会发生不同程度的退化，有些表现在生长缓慢，生长曲线不明显；有些表现在耗糖基本正常，但产物产量减少等。这时，就必须对菌种进行分离纯化。
其一般步骤是：取菌种进行全营养摇瓶培养（多做一些），对培养液进行稀释后涂布平板，一定要多做一些。培养后从中挑选出菌落直径大的单菌落（也要多挑一些），扩大培养后进行发酵培养基液体培养，测定产物产量，再多中挑选出产量高的。
这些挑选出的菌种要多传代几次，每次都要进行生长情况测定和产物测定，就是要保证它们的遗传稳定，才能作为生产菌种。
经过分离纯化后的菌种要多做一些，制成保藏菌种。一支菌种用于生产一段时间后，一旦生长情况不好，或产量下降较明显，就马上换菌种，不要等到明显不行了再换。
另外，分离纯化后的菌种要重新做最佳生长条件和发酵条件试验，取得最佳条件。因为菌种的遗传性状可能发生了变化。
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