这个其实也简单的，只要你在收到运输发票的时候直接将应付款计入销售方单位明细中，付款的时候自然是平的。而且如果你不放心的话，再让销货方开个说明书，说明运费由销货方代付，敲上销货单位公章就可以了。我们一般都是这么处理的。
商业企业或工业生产企业：
如果你公司是小规模纳税人：
运费处理：
借：库存商品 运费发票总金额（分摊进所购货物批次价格）
贷：银行存款 运费发票总金额（分摊进所购货物批次价格）
如果你公司是一般纳税人：
运费发票是增值税发票，运费处理：
借：库存商品 运费发票总金额减除运费发票所列的增值税分摊进所购货物批次价格
应缴税金——应缴增值税——进项税 运费发票所列的增值税额
贷：银行存款 运费发票总金额
如果是其他行业（非增值税应税行业）：
运费处理：
借：相关成本科目 发票金额
贷 ：银行存款 发票金额
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