增值税专用发票可以跨年认证入帐。
增值税专用发票跨年扫描认证是可以的。认证期限是180日。不受是否跨年度限制。在规定时间内未进行认证，不能抵扣进项税额，但是还是可以入账处理的。
购进的物资未验收入库，但对方增值税专用发票已经开具，购进方取得发票的时间推后，在取得增值税专用发票后才入账，这种情况也会存在的，是合理的。
增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的增值税专用发票、公路内河货物运输业统一发票和机动车销售统一发票，应在开具之日起180日内到税务机关办理认证，并在认证通过的次月申报期内，向主管税务机关申报抵扣进项税额。
【法律依据】
《中华人民共和国发票管理办法》
第十九条 销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票；特殊情况下，由付款方向收款方开具发票。第二十二条 开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖发票专用章。
任何单位和个人不得有下列虚开发票行为：
（一）为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；
（二）让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；
（三）介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票。第二十三条 安装税控装置的单位和个人，应当按照规定使用税控装置开具发票，并按期向主管税务机关报送开具发票的数据。
使用非税控电子器具开具发票的，应当将非税控电子器具使用的软件程序说明资料报主管税务机关备案，并按照规定保存、报送开具发票的数据。
国家推广使用网络发票管理系统开具发票，具体管理办法由国务院税务主管部门制定。
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