A、肺炎双球菌的转化实验和噬菌体侵染细菌的实验是设法将DNA与蛋白质分离开来，单独地、直接地研究各自在遗传中的作用，A正确；B、二者都运用了对照的原则，但只有噬菌体侵染细菌实验运用了同位素标记法，B错误；C、噬菌体侵染细菌实验比肺炎双球菌转化实验更具说服力，C错误；D、肺炎双球菌转化实验和噬菌体侵染细菌实验都不能证明绝大多数生物的遗传物质是DNA，少数的是RNA，D错误．故选：A．
