如果你发票作废了，开票系统里面也要作废，但因为该笔业务已经完成，所以需要重新给购货方开具发票。对账务处理没影响吧。如果你的财务系统需要录入发票，才能生成凭证，那就先把作废的发票红冲了（要生成相应的红冲凭证），然后重新录入发票，重新生成凭证。
你方是销售还是购货?
