几个世纪前,7个马铃薯栽培种中的普通栽培亚种(S.tuberosumsubsp.tuberosum)分布于智利南部,安第斯亚种(S.tuberosumsubsp.andigena)分布于南美的安第斯山地区,其他倍性的栽培种除了富里亚(S.phureja)广泛分布于秘鲁中部到厄瓜多尔、哥伦比亚和委内瑞拉外,只分布在从秘鲁中部至玻利维亚中部的安第斯高山地区。
马铃薯野生种只广泛分布于美洲大陆,从海平面到海拔4000m高山均有发现。从美国的西南到墨西哥的每个州、危地马拉、哥斯达黎加、洪都拉斯和巴拿马。南美除圭亚那外在每个国家均有分布,主要在委内瑞拉、哥伦比亚、厄瓜多尔、秘鲁、玻利维亚和阿根廷等国家的安第斯山区,以及秘鲁的沿海沙漠、智利中南部、阿根廷、巴拉圭和乌拉圭平原和巴西的东南部。虽然至今未发现某一个野生种分布于上述所有地点,但哥伦比亚薯(S.colombianum)、无茎薯(S.acaule)和恰柯薯(S.chacoense)比其他野生种的分布地域明显广泛,其他种只分布在非常有限的地区或生态区域。据统计,南美洲发现的野生种约占81%,北美和中美发现的野生种约占19%。