中山大学中山医学院临床医学专业有两种学制：
临床医学专业（八年制）：本博连读。培养基础扎实，人文素质好，能力强，发展后劲大，具有国际竞争力的高级临床医学专业人才。实施优生优培工程，全程配备优质导师，实行全程导学制度，全英文授课。整体课程依据全球医学教育标准要求对医学生提出的七大学习领域要求设计。毕业时授予医学博士学位。本专业从2004年开始招生，是历年高分考生的首选专业之一。
临床医学专业（五年制）（首批国家级特色专业建设点、广东省名牌专业）：培养从事临床医疗工作的全科医师，或在高校、研究机构从事教学、科研工作的高级人才。毕业生就业率高，就业面广，培养的多数毕业生已成为各有关单位的教学、科研、管理部门的骨干，受到各用人单位的普遍好评。开设的课程中大部分已经获评国家级或省级精品课程，具有雄厚的师资力量。