A、孟德尔在做豌豆杂交实验时，用豌豆纯合亲本杂交得F1，然后让F1自交，发生性状分离，经思考提出问题，A正确；
B、孟德尔所作假设的内容是“性状是遗传因子控制的，体细胞中遗传因子是成对的，配子中成对的遗传因子分离，受精时雌雄配子随机结合”，其中核心内容是“性状是遗传因子控制的”，B错误；
C、“若F1产生配子时的遗传因子分离，则测交后代的两种性状比接近1：1”，属于“演绎推理”的过程，C正确；
D、孟德尔运用统计学分析的方法对大量实验数据进行处理，从中找出规律，D正确．
故选：B．
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