主要有一下几点区别：
经费来源：民办院校是由社会集团，集体，及个人投资，自负盈亏是国家高等教育体系有益补充的一种教育体制。 公办是由国家拨款辅助的我国教育体制中的主要形式。
招生方面：公办学校招生是由各当地教委抽取建档线以上，直接进入高等院校学习深造 ，而民办院校则是在高考生进入高考期后，由本校派人直接到各地招收学员，各个学校由于各自的差异，因此在招生时选拔学生的方法也不同。 当然，有个别民办大专也进入普通高考录取。
对学生的关心程度差异：公办学校由于是国家拨款，所以对工资的需求不高，所以对学生的关心程度也会低于民办学校，而民办学校的工资是只能通过学费来发放的，所以为了更多的学生入学，他们的教学肯定会更倾向于学生。
影响力：现在有很多公办的大专最近学科建设也取得了一系列成绩，如果你工作能力到了，也有机会取得好工作。当然，有个别企业对民办高校还是有看法的，但最重要的还是你的能力。
学费方面：一般民办学校都比公办学校学费高。
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