1. 如果你们的租赁合同中约定不允许他在所租厂区内盖房,他私自建房就是违约,你可以和他协商,要求他拆除并赔偿损失,也可以到法院起诉。2. 如果你到法院起诉,请注意民事诉讼的时效是3年。自你发现是他违约建房时起计算。
得看你们的合约是怎么定的,再资讯法律法规,再看他建的厂房对你有利还是有弊,或者等到合同期满让他拆除就行,必径很多问题不一定非要走法律程序。