庄子哲学对后世影响很大。魏晋时期的玄学思潮融合儒、道,“祖述老庄”,玄学的代表人物向秀、郭家作《庄子注》;东晋南北朝盛行的佛教般者学中渗入儒道思想,很多名僧都研究庄子的思想,如友遁作《逍遥游论》,慧远早年“博综六经,尤善老庄”;唐代诏号《庄子》为《南华真经》,正式成为道家的经典之一。宋明理学以儒为主,融摄道释。