芥菜的根分为两大类，一类是根用芥菜的肉质根及其上面的须根；一类是非根用芥菜的根。这两类根在植物学形态上，差别很大。根用芥菜的根分为两部分，一部分是肉质根，一部分为吸收根——须根。其中肉质根的形态有圆柱形、圆锥形和近圆球形之分。肉质根分为根头部、根颈部和真根部，其中根头部和根颈部都在地面上，只有真根位于地下。真根部分的下半部分周围着生须根，以吸收水分和营养物质。
