DNA实验室常用的DNA提取方法有哪些

2024-11-18 08:39:12
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提取DNA主要有SDS和CTAB法,其实提取效果的好坏主要看提取的对象是什么样的材料,在提取之前一定要好好分析材料的特性,然后在设计实验步骤。
一)CTAB法
CTAB是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7 mol/L NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时,从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB与核酸的复合物同蛋白质、多糖类物质分开,然后将CTAB与核酸的复合物沉淀溶解于高盐溶液,再加入乙醇使核酸沉淀,CTAB能溶解于乙醇。
(二)SDS法
利用高浓度的SDS,在较高温度(55—65℃)条件下裂解细胞,使染色体离析,蛋白质变性,释放出核酸,然后采用提高盐浓度及降低温度的做法使蛋白质及多糖杂质沉淀(最常用的是加入5M的KAc于冰上保温,在低温条件下KAc与蛋白质及多糖结合成不溶物),离心除去沉淀后,上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,反复抽提后用乙醇沉淀水相中的DNA。
以下是在提取热带水果DNA时设计的两种不同方法步骤,对比起来CTAB法好,在禾本科植物效果差不多!
1、 CTAB法
1) 在所需量的CTAB抽提液中加入2-巯基乙醇,使终浓度达2%(v/v)。将此溶液预热至65℃。
对于每克新鲜的叶组织大约需要4ml的2-ME/CTAB抽提液。
2) 用液氮(-196℃)或干冰(-78℃)冷却粉碎器/匀浆器,将0.5 g植物组织粉碎成细粉,然后将组织转移到2.0 ml离心管。
3) 加入800 µl预热的2-Me/CTAB,混合使之充分湿润,于65℃温育20 min,不时颠倒混匀。
4) 待冷至室温后,加入800 µl氯仿/异戊醇(24:1),渗余颠倒混匀至溶液呈乳浊状----但不要振荡。25℃,10000 rpm离心10 min。
5) 上清(~700 µl)转移至另一干净的离心管中,加入5 µl RNaseA贮液,37℃温育30 min。
6) 加入700 µl氯仿/异戊醇,颠倒混匀,25℃,10000 rpm离心10 min。
7) 上清(~600 µl)转移至另一干净的1.5 ml离心管中,加入600 µl异丙醇,颠倒混匀,室温或-20℃放置20 min。
8) 25℃,12000 rpm,离心10 min,收集沉淀。
9) 去上清,加1 ml70%乙醇洗涤沉淀两次。(25℃,12000 rpm,离心10 min)
10)凉干DNA,溶于50 µl ddH2O,4℃保存备用。
2、 SDS法
① 将0.3 g植物材料于液氮速冻,然后在研钵中将其磨碎,尺唯将粉末转至2 ml离心管中。
② 加入1.2 ml预热至65℃的提取缓冲液(其中加入3 μl β—巯基乙醇,增加DNA的稳定性),置65℃水浴中放置30分钟,不时颠倒混匀。。
③ 加入0.45 ml 5M的醋酸钾,混匀,冰浴20分钟,在10000 rpm离心20 min。需要的话,Miracloth纱布过滤除去沉淀,上清液转入陵喊培另一离心管中。
④ 加入等体积氯仿:异戊醇(24:1),轻轻颠倒混匀,12000 rpm离心15 min。
⑤ 转移上清液到另一新离心管中,加5 μl RNaseA贮液,37℃温育30 min。
⑥ 加入等体积氯仿:异戊醇(24:1),轻轻颠倒混匀,12000 rpm离心15 min。
⑦ 转移上清液到另一新离心管中,加入0.7V异丙醇,轻轻颠倒混匀,-20℃放置30分钟沉淀核酸。
⑧ 25℃,12000 rpm,离心10 min,收集沉淀。
⑨ 弃上清,70%乙醇洗两次。
⑩ 凉干DNA,溶于50 µl ddH2O,4℃保存备用。