当然有风险
任何用人单位都无权以任何理由扣留求职者的任何证件,像你说的情况,风险控制措施本来是单位自己要解决的事,但是有些单位仗着就业形势不好,把风险转嫁到员工身上。这种你只好自己取舍到底要不要做这份工作了。但把毕业证书抵押在单位肯定是有风险的,指不定日后你要离开时它找理由扣着你的证书,那就烦了……