不同微生物在不同领域有不同作用，即使同种微生物在不同领域也有不同作用，拿乳酸菌来说，在动物肠道可以帮助消化，进而提高动物免疫力，而放到水产上则可以调节水质，改善水体，放在农业上（单一用还很少，EM菌里的乳酸菌在农业上有应用）则可以防虫害，促进植物生长。
