A、白眼突变体与野生型杂交，F1全部表现野生型，雌雄比例1：1，只能说明野生型相对于突变型是显性性状，不能判断白眼基因位于X染色体上，A错误；
B、F1中雌雄果蝇杂交，后代出现性状分离，且白眼全部为雄性，说明这一对性状的遗传与性别有关，且雌雄果蝇具有该性状，说明控制该性状的基因位于X染色体上，B正确；
C、F1雌性与白眼雄性杂交，后代出现白眼，且雌雄比例1：1，这属于测交类型，仍不能说明白眼基因位于X染色体上，C错误；
D、白眼雌性与野生型雄性杂交，后代白眼全部雄性，野生型全部雌性，能说明控制该性状的基因位于X染色体上，但不是最早说明白眼基因位于X染色体上的实验结果，D错误．
故选：B．
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