layers默认为无空间参考，当你添加一个图层时会变成与该图层一致的空间参考，更改其下图层的空间参考也要同时更改它的，或者新建一个空的。
那说明你修改的投影有问题，你最好不要直接编辑修改投影信息（除非你要修改的本身就是错的），最好进行投影变换。
提示很明确，你更改后两个图层范围不一致了，检查这些图层的空间参考吧
